Lyngbya aestuarii é uma cianobactéria filamentosa formadora de tapetes encontrada em planícies de maré, pântanos salgados e ambientes estuarinos. Produz tricomas robustos dentro de bainhas firmes e é um produtor primário importante nos ecossistemas bentônicos costeiros. Algumas linhagens são conhecidas por produzir metabólitos secundários bioativos ou tóxicos. Seu estado de conservação não foi avaliado.