Lyngbya aestuarii es una cianobacteria filamentosa formadora de tapetes que se encuentra en marismas de marea, marismas salinas y entornos estuarinos. Produce tricomas robustos dentro de vainas firmes y es un productor primario importante en los ecosistemas bentónicos costeros. Algunas cepas son conocidas por producir metabolitos secundarios bioactivos o tóxicos. Su estado de conservación no ha sido evaluado.